Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q6

TNFRSF11A, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF11AQ9Y6Q6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF11AQ9Y6Q6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF11AQ9Y6Q6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF11AQ9Y6Q6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF11AQ9Y6Q6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF11AQ9Y6Q6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TNFRSF11AQ9Y6Q6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TNFRSF11AQ9Y6Q6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms