Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AGAP1Q9UPQ3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AGAP1Q9UPQ3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AGAP1Q9UPQ3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms