Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BRPF3Q9ULD4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BRPF3Q9ULD4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms