Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MKLN1Q9UL63 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
MKLN1Q9UL63 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKLN1Q9UL63 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MKLN1Q9UL63 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms