Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GGA1Q9UJY5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GGA1Q9UJY5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms