Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBE1Q9UJT0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBE1Q9UJT0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBE1Q9UJT0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms