Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
COPS7AQ9UBW8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
COPS7AQ9UBW8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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