Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SCHIP1Q9P0W5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SCHIP1Q9P0W5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms