Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM53CQ9NYF3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM53CQ9NYF3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms