Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLHL11Q9NVR0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLHL11Q9NVR0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms