Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRMS1Q9HCU9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRMS1Q9HCU9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms