Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COG4Q9H9E3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COG4Q9H9E3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms