Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I2

ZHX3, Zinc fingers and homeoboxes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZHX3Q9H4I2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZHX3Q9H4I2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZHX3Q9H4I2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms