Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
HIRIP3Q9BW71 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC31.57■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
HIRIP3Q9BW71 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC31.5■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
HIRIP3Q9BW71 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms