Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SMIM2Q9BVW6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMIM2Q9BVW6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SMIM2Q9BVW6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM2Q9BVW6 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM2Q9BVW6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM2Q9BVW6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM2Q9BVW6 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM2Q9BVW6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM2Q9BVW6 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM2Q9BVW6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM2Q9BVW6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM2Q9BVW6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM2Q9BVW6 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SMIM2Q9BVW6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms