Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAMKK2Q96RR4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAMKK2Q96RR4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMKK2Q96RR4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMKK2Q96RR4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMKK2Q96RR4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMKK2Q96RR4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMKK2Q96RR4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMKK2Q96RR4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMKK2Q96RR4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMKK2Q96RR4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMKK2Q96RR4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMKK2Q96RR4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMKK2Q96RR4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAMKK2Q96RR4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CAMKK2Q96RR4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CAMKK2Q96RR4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CAMKK2Q96RR4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms