Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RAB3IPQ96QF0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RAB3IPQ96QF0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms