Protein–RNA interactions for Protein: Q96P48

ARAP1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP1Q96P48 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ARAP1Q96P48 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ARAP1Q96P48 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ARAP1Q96P48 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms