Protein–RNA interactions for Protein: Q96HF1

SFRP2, Secreted frizzled-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP2Q96HF1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SFRP2Q96HF1 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SFRP2Q96HF1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms