Protein–RNA interactions for Protein: Q96DU9

PABPC5, Polyadenylate-binding protein 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC5Q96DU9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PABPC5Q96DU9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PABPC5Q96DU9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms