Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMIGD2Q96BF3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMIGD2Q96BF3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms