Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HDAC7Q8WUI4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HDAC7Q8WUI4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC7Q8WUI4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC7Q8WUI4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC7Q8WUI4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC7Q8WUI4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC7Q8WUI4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC7Q8WUI4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC7Q8WUI4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HDAC7Q8WUI4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC7Q8WUI4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC7Q8WUI4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC7Q8WUI4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC7Q8WUI4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC7Q8WUI4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HDAC7Q8WUI4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HDAC7Q8WUI4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms