Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG27

PJA1, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-1, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA1Q8NG27 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PJA1Q8NG27 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PJA1Q8NG27 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms