Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF397Q8NF99 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF397Q8NF99 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms