Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CNNM3Q8NE01 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CNNM3Q8NE01 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms