Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
DTX3Q8N9I9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DTX3Q8N9I9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DTX3Q8N9I9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms