Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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CLDN19Q8N6F1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLDN19Q8N6F1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLDN19Q8N6F1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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