Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RYBPQ8N488 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RYBPQ8N488 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RYBPQ8N488 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms