Protein–RNA interactions for Protein: Q8N300

SVBP, Small vasohibin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVBPQ8N300 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SVBPQ8N300 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SVBPQ8N300 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms