Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASSF3Q86WH2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASSF3Q86WH2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASSF3Q86WH2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RASSF3Q86WH2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RASSF3Q86WH2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RASSF3Q86WH2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms