Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRAPPC11Q7Z392 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAPPC11Q7Z392 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms