Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CHST3Q7LGC8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHST3Q7LGC8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133 ms