Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX8Q6ZV50 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFX8Q6ZV50 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms