Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3E5

GDPD4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD4Q6W3E5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms