Protein–RNA interactions for Protein: Q6W3E5

GDPD4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD4Q6W3E5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GDPD4Q6W3E5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GDPD4Q6W3E5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms