Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 MALAT1-217ENST00000620902 352 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CHIC1Q5VXU3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
CHIC1Q5VXU3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CHIC1Q5VXU3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms