Protein–RNA interactions for Protein: Q5TKA1

LIN9, Protein lin-9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN9Q5TKA1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LIN9Q5TKA1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LIN9Q5TKA1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN9Q5TKA1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN9Q5TKA1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN9Q5TKA1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN9Q5TKA1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LIN9Q5TKA1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms