Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PXDC1Q5TGL8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms