Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY00

TSGA10IP, Testis-specific protein 10-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA10IPQ3SY00 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSGA10IPQ3SY00 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSGA10IPQ3SY00 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSGA10IPQ3SY00 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSGA10IPQ3SY00 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TSGA10IPQ3SY00 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TSGA10IPQ3SY00 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms