Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
KRTAP21-1Q3LI58 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms