Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HERC3Q15034 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HERC3Q15034 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
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