Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 SNORA52-201ENST00000362915 134 ntBASIC13.92□□□□□ -0.181e-323■■■□□ 15
NOLC1Q14978 RPLP2-206ENST00000530398 313 ntTSL 312.83□□□□□ -0.361e-323■■■□□ 15
NOLC1Q14978 RPLP2-204ENST00000526222 350 ntTSL 212.25□□□□□ -0.451e-323■■■□□ 15
NOLC1Q14978 RPLP2-203ENST00000525722 489 ntTSL 212.25□□□□□ -0.451e-323■■■□□ 15
NOLC1Q14978 SF3B1-201ENST00000335508 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.22e-10■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.722e-6■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 CPE-205ENST00000513982 564 ntTSL 48.77□□□□□ -1.012e-6■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 CPE-204ENST00000511992 563 ntTSL 58.06□□□□□ -1.122e-6■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 CPE-202ENST00000431967 633 ntTSL 47.83□□□□□ -1.162e-6■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 PABPC1-203ENST00000517921 885 ntTSL 511.53□□□□□ -0.561e-9■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 PABPC1-222ENST00000523555 522 ntTSL 310.42□□□□□ -0.741e-9■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 SEC14L1-204ENST00000436233 5295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.193e-6■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 SEC14L1-205ENST00000443798 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.513e-6■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.384e-6■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.384e-6■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 ABCC1-204ENST00000572882 4565 ntTSL 1 (best)11.43□□□□□ -0.584e-6■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 RBM14-RBM4-202ENST00000421355 2034 ntTSL 221.93■■□□□ 1.12e-8■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.052e-8■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.752e-8■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.632e-8■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.592e-8■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 RBM14-RBM4-204ENST00000511114 523 ntTSL 413.48□□□□□ -0.252e-8■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.119e-7■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 PCK2-214ENST00000560736 897 ntTSL 324.72■■□□□ 1.559e-7■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 PCK2-206ENST00000558674 2189 ntTSL 221.75■■□□□ 1.079e-7■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 PCK2-215ENST00000561050 1856 ntTSL 220.67■□□□□ 0.99e-7■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC2.3□□□□□ -2.041e-323■■■□□ 14.9
NOLC1Q14978 HYOU1-207ENST00000530473 2023 ntTSL 515.73■□□□□ 0.111e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 HYOU1-215ENST00000543287 2464 ntTSL 221.09■□□□□ 0.971e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 AP1B1-209ENST00000472057 727 ntTSL 315.22■□□□□ 0.036e-27■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.36□□□□□ -1.396e-27■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.69□□□□□ -1.666e-27■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.745e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.435e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 EPCAM-205ENST00000474691 714 ntTSL 515.06■□□□□ 05e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 EPCAM-204ENST00000456133 1501 ntTSL 514.52□□□□□ -0.085e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 EPCAM-206ENST00000490733 752 ntTSL 35.27□□□□□ -1.575e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.132e-11■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 PRPF8-201ENST00000304992 7295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.62e-11■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.983e-14■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.623e-14■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 SPP1-210ENST00000513981 719 ntTSL 36.67□□□□□ -1.349e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 SPP1-208ENST00000509334 760 ntTSL 55.85□□□□□ -1.479e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.72□□□□□ -2.291e-323■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 ADAMTSL4-206ENST00000489159 1803 ntTSL 220■□□□□ 0.793e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 ADAMTSL4-203ENST00000369039 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.233e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.133e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.053e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.911e-10■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.223e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.111e-10■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.083e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.043e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 KAT2A-203ENST00000586972 852 ntTSL 221.4■■□□□ 1.023e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.993e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.793e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.543e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.53e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 EIF3B-207ENST00000465670 2766 ntTSL 217.66■□□□□ 0.423e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 EIF3B-210ENST00000468611 1868 ntTSL 216.8■□□□□ 0.283e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 KAT2A-202ENST00000465682 2990 ntTSL 514.55□□□□□ -0.083e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 TULP4-206ENST00000616856 2307 ntTSL 214.29□□□□□ -0.123e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 ARPC5-203ENST00000367534 622 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.163e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 ARPC5-202ENST00000359856 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.343e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 EIF3B-211ENST00000475415 3745 ntTSL 212.31□□□□□ -0.443e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 TULP4-201ENST00000367094 5170 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.553e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 EIF4A3-206ENST00000575978 3593 ntTSL 29.68□□□□□ -0.863e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.933e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 AL360169.2-201ENST00000619713 561 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.963e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 EIF4A3-208ENST00000576573 697 ntTSL 28.56□□□□□ -1.043e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 EIF4A3-202ENST00000570625 562 ntTSL 26.05□□□□□ -1.443e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 ARPC5-204ENST00000462965 2455 ntTSL 24.83□□□□□ -1.643e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 PRPF8-216ENST00000577001 3274 ntTSL 517.62■□□□□ 0.419e-7■■■□□ 14.8
NOLC1Q14978 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.57□□□□□ -1.521e-323■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC6.28□□□□□ -1.47e-21■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 RPL34-207ENST00000506397 549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.326e-21■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 RPL34-201ENST00000394665 529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.016e-21■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 RPL34-202ENST00000394667 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.016e-21■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 RPL34-206ENST00000504231 629 ntTSL 1 (best)8.48□□□□□ -1.056e-21■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 RPL34-204ENST00000502534 560 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.48□□□□□ -1.056e-21■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.446e-21■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.12e-6■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 CLTC-215ENST00000621829 8587 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.257e-7■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.927e-7■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 CLTC-210ENST00000579456 2301 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.042e-6■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.141e-6■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.011e-6■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 BCAP31-206ENST00000442093 793 ntTSL 224.67■■□□□ 1.541e-6■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 BCAP31-204ENST00000429550 684 ntTSL 322.16■■□□□ 1.141e-6■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 BCAP31-202ENST00000416815 688 ntTSL 520.34■□□□□ 0.851e-6■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 BCAP31-203ENST00000423827 669 ntTSL 516.4■□□□□ 0.221e-6■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.131e-6■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.114e-8■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.14e-8■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 PERP-201ENST00000421351 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.031e-6■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 HYOU1-208ENST00000531682 319 ntTSL 213.17□□□□□ -0.33e-28■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 ZDHHC11-211ENST00000512775 495 ntTSL 412.65□□□□□ -0.381e-6■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 BCAP31-205ENST00000430088 570 ntTSL 29.16□□□□□ -0.941e-6■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 ZDHHC11-207ENST00000508951 388 ntTSL 38.54□□□□□ -1.041e-6■■■□□ 14.7
NOLC1Q14978 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.235e-9■■■□□ 14.7
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