Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.286e-7■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 FAM19A5-205ENST00000473898 897 ntTSL 219.63■□□□□ 0.736e-7■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.246e-7■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 FAM19A5-201ENST00000336769 546 ntTSL 411.95□□□□□ -0.56e-7■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 DUXAP8-204ENST00000447898 4136 ntTSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.911e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 ZNF248-209ENST00000615949 518 ntTSL 5 BASIC6.42□□□□□ -1.381e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.981e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 UBE3C-207ENST00000494532 543 ntTSL 214.32□□□□□ -0.121e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 UBE3C-205ENST00000470408 5197 ntTSL 210.59□□□□□ -0.711e-6■■□□□ 13.6
HLTFQ14527 ZKSCAN1-205ENST00000535170 8758 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.376e-9■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 ZKSCAN1-206ENST00000620510 9192 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.476e-9■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.686e-9■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 MIR4713HG-201ENST00000559909 561 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.551e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.052e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 UBA6-AS1-205ENST00000506606 2233 ntTSL 29.71□□□□□ -0.862e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.572e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 UBA6-AS1-207ENST00000514109 786 ntTSL 34.85□□□□□ -1.632e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.566e-7■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 PLCB1-214ENST00000626161 706 ntTSL 516.42■□□□□ 0.226e-7■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 SH3YL1-216ENST00000471948 2119 ntTSL 223.57■■□□□ 1.362e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.292e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 SH3YL1-213ENST00000463865 1999 ntTSL 520.59■□□□□ 0.892e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 ZNF432-204ENST00000598446 862 ntTSL 318.28■□□□□ 0.522e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.282e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 SH3YL1-224ENST00000488044 672 ntTSL 415.83■□□□□ 0.122e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 SH3YL1-220ENST00000475027 599 ntTSL 512.48□□□□□ -0.412e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 SH3YL1-204ENST00000403658 1279 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.412e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 SH3YL1-210ENST00000454318 581 ntTSL 312□□□□□ -0.492e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 ZNF841-207ENST00000601738 2027 ntTSL 511.48□□□□□ -0.572e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 SH3YL1-219ENST00000473104 2463 ntTSL 1 (best)10.22□□□□□ -0.772e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 SH3YL1-229ENST00000626873 1973 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.792e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 SH3YL1-225ENST00000488979 541 ntTSL 59.91□□□□□ -0.822e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 SH3YL1-222ENST00000479739 2236 ntTSL 29.88□□□□□ -0.832e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 SH3YL1-202ENST00000402632 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.832e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 SH3YL1-205ENST00000403712 1695 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.982e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 SH3YL1-215ENST00000468321 2739 ntTSL 1 (best)8.88□□□□□ -0.992e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.042e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 ZNF841-203ENST00000594295 3819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.052e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 ZNF841-201ENST00000389534 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.172e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.32e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 SH3YL1-207ENST00000415368 494 ntTSL 35.7□□□□□ -1.52e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.856e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.721e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 TBL1X-203ENST00000407597 5596 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.121e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.141e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.171e-6■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 TULP4-202ENST00000367097 11295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.845e-7■■□□□ 13.5
HLTFQ14527 GOLGB1-209ENST00000614479 11115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.986e-7■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.16e-7■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.246e-7■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 GOLGB1-205ENST00000482512 10295 ntTSL 1 (best)6.89□□□□□ -1.316e-7■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.793e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 EDEM1-206ENST00000465369 1956 ntTSL 525.14■■□□□ 1.623e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 NCOA5-202ENST00000372291 727 ntTSL 324.45■■□□□ 1.53e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 USP48-214ENST00000532737 680 ntTSL 424.38■■□□□ 1.493e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 NOTUM-202ENST00000425009 996 ntTSL 324.18■■□□□ 1.463e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.393e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.343e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.343e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.983e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 NOTUM-204ENST00000489218 972 ntTSL 218.9■□□□□ 0.623e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.613e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 PRKAR1B-206ENST00000417852 651 ntTSL 218.83■□□□□ 0.63e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.553e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 TAF1C-217ENST00000566903 2628 ntTSL 516.92■□□□□ 0.33e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 PRKAR1B-209ENST00000478198 602 ntTSL 316.78■□□□□ 0.283e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.163e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 TAF1C-212ENST00000564774 4637 ntTSL 215.5■□□□□ 0.073e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 POLG-213ENST00000631044 4668 ntTSL 515.39■□□□□ 0.053e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 POLG-203ENST00000526314 700 ntTSL 315.25■□□□□ 0.033e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 MGA-210ENST00000568630 584 ntTSL 315.08■□□□□ 03e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 03e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 POLG-217ENST00000636774 4151 ntTSL 514.59□□□□□ -0.073e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 PRKAR1B-210ENST00000488474 617 ntTSL 314.12□□□□□ -0.153e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 TAF1C-201ENST00000341690 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.23e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 EDEM1-202ENST00000434243 978 ntTSL 213.28□□□□□ -0.283e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 TAF1C-218ENST00000567759 3879 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.33e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 TAF1C-203ENST00000541676 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.343e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 TAF1C-209ENST00000564208 3810 ntTSL 212.37□□□□□ -0.433e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 POLG-221ENST00000637238 3022 ntTSL 512.22□□□□□ -0.453e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 NRIP1-205ENST00000637630 573 ntTSL 312.1□□□□□ -0.475e-9■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 BRCA1-222ENST00000493919 1948 ntTSL 212.06□□□□□ -0.483e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 BRCA1-225ENST00000586385 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.493e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 NRIP1-207ENST00000638122 543 ntTSL 1 (best)11.95□□□□□ -0.55e-9■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 IK-205ENST00000508301 868 ntTSL 211.78□□□□□ -0.523e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 IK-204ENST00000507593 489 ntTSL 311.78□□□□□ -0.523e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 POLG-222ENST00000637264 3153 ntTSL 511.65□□□□□ -0.543e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 MGA-204ENST00000563576 3537 ntTSL 511.18□□□□□ -0.623e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 IK-201ENST00000417647 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.693e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 MGA-208ENST00000566718 3439 ntTSL 210.68□□□□□ -0.73e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 NRIP1-206ENST00000637963 498 ntTSL 410.48□□□□□ -0.735e-9■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 BRCA1-205ENST00000461221 5693 ntTSL 1 (best)10.41□□□□□ -0.743e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 SH3BP5-AS1-202ENST00000420195 5570 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.783e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 BRCA1-227ENST00000591849 563 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.823e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 BRCA1-219ENST00000491747 2379 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.833e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 BRCA1-226ENST00000591534 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.93e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 IK-203ENST00000503332 540 ntTSL 49.14□□□□□ -0.953e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.953e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 BRCA1-201ENST00000352993 3668 ntTSL 5 BASIC8.52□□□□□ -1.053e-6■■□□□ 13.4
HLTFQ14527 USPL1-201ENST00000255304 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.52□□□□□ -1.053e-6■■□□□ 13.4
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