Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CACNA1CQ13936 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CACNA1CQ13936 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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