Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
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ITGA9Q13797 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ITGA9Q13797 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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ITGA9Q13797 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ITGA9Q13797 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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