Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
RIPPLY1Q0D2K3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
RIPPLY1Q0D2K3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
RIPPLY1Q0D2K3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms