Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PDE4CQ08493 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PDE4CQ08493 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms