Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RIPPLY3P57055 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RIPPLY3P57055 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms