Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX9P55771 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX9P55771 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX9P55771 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX9P55771 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX9P55771 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX9P55771 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX9P55771 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX9P55771 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX9P55771 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX9P55771 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX9P55771 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PAX9P55771 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PAX9P55771 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX9P55771 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX9P55771 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX9P55771 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX9P55771 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX9P55771 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX9P55771 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX9P55771 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX9P55771 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX9P55771 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX9P55771 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PAX9P55771 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX9P55771 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX9P55771 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX9P55771 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX9P55771 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX9P55771 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX9P55771 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX9P55771 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX9P55771 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX9P55771 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX9P55771 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX9P55771 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX9P55771 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX9P55771 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX9P55771 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX9P55771 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PAX9P55771 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PAX9P55771 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX9P55771 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX9P55771 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX9P55771 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX9P55771 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX9P55771 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX9P55771 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX9P55771 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX9P55771 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX9P55771 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX9P55771 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX9P55771 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX9P55771 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PAX9P55771 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX9P55771 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX9P55771 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX9P55771 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX9P55771 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX9P55771 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX9P55771 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX9P55771 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX9P55771 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX9P55771 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX9P55771 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX9P55771 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX9P55771 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX9P55771 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PAX9P55771 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX9P55771 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX9P55771 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX9P55771 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX9P55771 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX9P55771 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX9P55771 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX9P55771 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX9P55771 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX9P55771 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX9P55771 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PAX9P55771 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms