Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMP1P54849 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMP1P54849 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMP1P54849 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMP1P54849 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
EMP1P54849 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMP1P54849 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMP1P54849 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMP1P54849 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMP1P54849 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMP1P54849 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMP1P54849 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMP1P54849 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMP1P54849 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMP1P54849 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
EMP1P54849 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMP1P54849 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMP1P54849 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
EMP1P54849 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMP1P54849 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMP1P54849 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMP1P54849 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMP1P54849 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMP1P54849 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMP1P54849 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMP1P54849 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMP1P54849 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EMP1P54849 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMP1P54849 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMP1P54849 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMP1P54849 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMP1P54849 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMP1P54849 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMP1P54849 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMP1P54849 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
EMP1P54849 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMP1P54849 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EMP1P54849 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMP1P54849 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMP1P54849 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMP1P54849 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMP1P54849 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMP1P54849 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EMP1P54849 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMP1P54849 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMP1P54849 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMP1P54849 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMP1P54849 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EMP1P54849 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMP1P54849 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMP1P54849 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMP1P54849 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMP1P54849 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EMP1P54849 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMP1P54849 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMP1P54849 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EMP1P54849 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMP1P54849 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMP1P54849 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMP1P54849 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMP1P54849 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMP1P54849 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMP1P54849 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMP1P54849 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMP1P54849 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMP1P54849 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EMP1P54849 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMP1P54849 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMP1P54849 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMP1P54849 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMP1P54849 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMP1P54849 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMP1P54849 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMP1P54849 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMP1P54849 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMP1P54849 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMP1P54849 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMP1P54849 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMP1P54849 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMP1P54849 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMP1P54849 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMP1P54849 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
EMP1P54849 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EMP1P54849 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
EMP1P54849 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EMP1P54849 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
EMP1P54849 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMP1P54849 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMP1P54849 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMP1P54849 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMP1P54849 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMP1P54849 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMP1P54849 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMP1P54849 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMP1P54849 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMP1P54849 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMP1P54849 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMP1P54849 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
EMP1P54849 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
EMP1P54849 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms