Protein–RNA interactions for Protein: P52815

MRPL12, 39S ribosomal protein L12, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL12P52815 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRPL12P52815 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRPL12P52815 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms